Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Csnka2ipQ8CH19 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Csnka2ipQ8CH19 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Csnka2ipQ8CH19 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Csnka2ipQ8CH19 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Csnka2ipQ8CH19 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Csnka2ipQ8CH19 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Csnka2ipQ8CH19 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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