Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms