Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms