Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms