Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms