Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms