Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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