Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms