Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms