Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1aQ61495 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms