Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms