Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms