Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm11487Q5RIS0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm11487Q5RIS0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm11487Q5RIS0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm11487Q5RIS0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm11487Q5RIS0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm11487Q5RIS0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm11487Q5RIS0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm11487Q5RIS0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm11487Q5RIS0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm11487Q5RIS0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm11487Q5RIS0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm11487Q5RIS0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm11487Q5RIS0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm11487Q5RIS0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm11487Q5RIS0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm11487Q5RIS0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm11487Q5RIS0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm11487Q5RIS0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms