Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms