Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms