Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms