Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms