Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fubp3Q3TIX6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms