Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp8Q2V6D6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms