Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms