Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms