Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms