Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms