Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox4Q06831 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox4Q06831 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms