Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms