Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms