Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms