Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcqQ02111 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms