Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms