Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms