Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33aP97950 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms