Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms