Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UbdP63072 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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