Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms