Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps11P62281 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms