Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CcnfP51944 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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