Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Matn1P51942 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Matn1P51942 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Matn1P51942 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Matn1P51942 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms