Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfP51642 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfP51642 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfP51642 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfP51642 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms