Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa11P50709 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms