Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SftpbP50405 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms