Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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