Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspa9P38647 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms