Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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