Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh1a1P24549 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh1a1P24549 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh1a1P24549 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh1a1P24549 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh1a1P24549 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh1a1P24549 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh1a1P24549 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh1a1P24549 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aldh1a1P24549 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms