Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bmp4P21275 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bmp4P21275 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms