Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Fcer1aP20489 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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