Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms