Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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P18527 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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P18527 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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P18527 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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P18527 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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P18527 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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P18527 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18527 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18527 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18527 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18527 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18527 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms