Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa1P11477 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms