Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms